L'agent causal de la COVID-19 és el coronavirus SARS-CoV-2. Pertany a una àmplia família de virus, que pot afectar tant les persones com els animals. En les persones, causa infeccions respiratòries comunes, com ara el refredat, o d'altres més greus, com la síndrome respiratòria aguda severa (SARS) o la síndrome respiratòria de l'Orient Mitjà (MERS).
Com qualsevol virus, el SARS-CoV-2 pot presentar canvis genètics al llarg del temps, la qual cosa pot donar lloc a noves variants. Durant la pandèmia de COVID-19, van sorgir diverses variants designades amb les lletres de l'alfabet grec (alfa, delta, òmicron) i posteriorment n'han aparegut de noves (descendents del llinatge d'òmicron), com l'EG.5, també coneguda com a ERIS; la BA.2.86, coneguda com a Pirola, i la JN.1.
Les variants poden comportar canvis en algunes característiques importants del virus, com la seva facilitat de transmissió, el tipus de símptomes que provoca o la capacitat de causar afeccions més o menys greus.